2022重庆邮电大学自命题考研大纲：生物信息学（F052）

　　重庆邮电大学 2022 年硕士研究生入学

　　《生物信息学(F052)》考试大纲》

　　满分：100

　　考试性质：复试科目

　　考试方式和考试时间：闭卷

　　试卷结构：名词解释(20%);填空题(20%);分析题(30%);综合题(30%);括号为题型大约占据的百分比。以实际考题为准。

　　考试内容和要求

　　1、生物信息学概念及其发展历史：了解生物信息学发展历史、主要研究领域和主要应用;理解并掌握生物信息学的概念。了解生物信息学发展面临的主要问题和研究生物信息学所掌握的主要技能。掌握生物信息学 的常用网站 NCBI 等搜索生物信息学工具的方法。

　　2、生物数据库及其检索：了解生物学数据库的内容和结构;了解生物学数据库的数据存储格式;掌握生物学数据库的检索方法。熟悉常用的生物学数据库。

　　3、序列比对原理及应用：了解双序列比对和多序列比对的概念;掌握常用的核酸和蛋白质打分矩阵;了解双序列比对算法。了解多重比对算法，掌握常用的序列比对工具的使用方法。

　　4、基因组注释：了解蛋白质编码基因、重复序列和假基因的注释方法。掌握 RNA 基因注释方法。了解一种真核生物基因组注释的案例。

　　5、蛋白质结构分析与预测：了解蛋白质结构组织层次;掌握蛋白质结构预测的常用方法;理解蛋白质对接和分子对接。了解与蛋白质折叠相关的疾病。

　　6、蛋白质组分析：了解蛋白质的大规模分离鉴定技术简介;掌握串联质谱鉴定蛋白质组方法及蛋白质组学概念。了解蛋白质的翻译后修饰和分选的方法大规模分离鉴定技术简介;掌握蛋白质相互作用网络研究方法。

　　7、转录组分析：了解转录组基本概念及转录组测序方法。掌握转录组分析的基本原理、方法和分析内容。 掌握一个转录组分析的案例。

　　8、非编码 RNA 分析：了解非编码 RNA 的分类;了解 miRNA 的生物合成和生物信息学分析方法。

　　9、分子进化与系统发育：了解分子进化与系统发育的概念;掌握几种基于距离的系统发生树构建方法。了解最大似然法、最大简约法和贝叶斯方法的原理;了解基于全基因组数据的系统发生树构建方法。了解系统发生树构建的应用;掌握 Mega 软件使用方法。

　　10、聚类算法及其应用：掌握基因表达分析基本概念;熟悉系统聚类基本概念;掌握 k-均值聚类算法基本思想;熟悉进化树与系统聚类(UPGMA 算法)

　　11、隐马尔科夫模型及其应用：了解 CG 岛和“公平赌场”问题;掌握公平赌场和隐马氏模型基本概念;了解解码算法;熟悉隐马氏模型参数估计。

　　12、机器学习及其应用：掌握机器学习的概念，了解经典的机器学习算法。

　　13、新一代测序技术及其应用: 了解测序技术的发展过程;掌握第二代测序技术原理;了解第三代测序技

　　术;了解新一代测序技术在生物学研究中的应用。

　　参考书目

　　1、《生物信息学》(第 3 版)陈铭，科学出版社

　　2、《生物信息学：序列与基因组分析(英文版)》David W. Mount，科学出版社

　　原文链接：http://yjs.cqupt.edu.cn/info/1006/7815.htm